В своей деятельности отдел руководствуется Конституцией Российской Федерации, Федеральными конституционными законами, Федеральными законами, Указами и распоряжениями Президента Российской Федерации, постановлениями и распоряжениями Правительства Российской Федерации, приказами и иными нормативными актами МЧС, МВД и Министерства обороны Российской Федерации, Уставом Института, локальными актами и приказами начальника Института.